Исследователи из Каролинского института разработали молекулярный метод, способный определить, реагируют ли бактерии на антибиотики в течение нескольких минут. Результаты представлены в журнале Nature Microbiology, и теперь исследователи надеются разработать простой тест для использования врачами.
«Мы уверены и надеемся, что это может быть одним из многих инструментов, которые нужны врачам для борьбы с устойчивостью к антибиотикам, которая является серьезной и растущей проблемой», -говорит главный исследователь Висент Пелечано, доцент кафедры микробиологии, опухолевой и клеточной биологии Каролинского института.
Метод называется 5PSeq, прост в использовании и основан на секвенировании матричной РНК (мРНК), которую бактерии расщепляют при синтезе белков. Измерения показывают, как на бактерии влияют различные факторы окружающей среды, такие как лечение антибиотиками и другие виды стресса.
Исследователи протестировали метод в общей сложности на 96 видах бактерий разных типов в сложных клинических образцах, взятых, например, из фекалий и влагалища, а также в образцах компоста. Всего через несколько минут они смогли увидеть, реагируют ли бактерии на лечение антибиотиками или нет; эффект был наиболее заметен примерно через полчаса.
3N Bio - это компания, которую доктор Пелехано и несколько его коллег основали в инновационном инкубаторе KI для разработки метода и создания экспресс-молекулярного теста для клинического применения. Теперь они получили финансирование от Шведского исследовательского совета, чтобы продемонстрировать доказательство концепции такого теста в сотрудничестве с больницей Каролинского университета.
«Крайне важно, чтобы врачи могли быстро подобрать подходящие антибиотики для тяжелобольных пациентов с бактериальными инфекциями, чтобы сократить ненужное использование антибиотиков», — говорит д-р Пелечано. «Существующие методы тестирования на устойчивость к антибиотикам могут занять часы или даже дни, но часто лечение необходимо назначать быстрее, чтобы избежать серьезных последствий для пациента. Из-за этого часто назначают антибиотик широкого спектра действия, что увеличивает риск резистентности».
Помимо измерения устойчивости к антибиотикам, этот метод может быть использован для того, чтобы помочь исследователям понять, как бактерии справляются со стрессом и взаимодействуют друг с другом и со своими хозяевами. Исследователи продолжат изучать сложные образцы кишечника, чтобы выяснить, как бактериальные сообщества взаимодействуют в нашем кишечнике и способствуют здоровью и болезням.
Исследование финансировалось фондом Рагнара Седерберга (стартовый грант шведских фондов), Шведским исследовательским советом, фондом Кнута и Алисы Валленбергов (стипендия Академии Валленберга) и программой ЕС "Горизонт 2020", среди прочих. Полный список смотрите в научной статье. Соучредителями 3N Bio были Висент Пелечано и два первых автора статьи, Сюзанна Хуч и Лилит Нерсисян.